1999年贵州大学成立农业生物工程重点实验室，2002年贵州省科技厅批准成立贵州省农业生物工程重点实验室，2008年成为贵州大学直属的处级科研机构，2013年省编委批准成立贵州大学农业生物工程研究院。研究院下设3个研究所和1个中心，拥有1个教育部重点实验室、1个国家地方联合工程中心、3个省级创新人才团队、1个省级重点实验室，是生物学国内一流学科、博士点、博士后流动站的建设单位，“贵州省植物生理与植物分子生物学学会”和“贵州省生物化学与分子生物学会”的挂靠单位和理事长单位。